Bardzo ważne w pielęgnacji atopowego zapalenia skóry są środki higieny, jakich używamy, a przede wszystkim mydła (płyny do kąpieli).
Najbardziej polecane są preparaty wspomagające leczenie – mydła w płynach, o właściwościach natłuszczających, odkażających, lub płyny do kąpieli zmiękczające wodę. W zasadzie powinno się unikać używania mydeł - oprócz oczyszczania skóry z zanieczyszczeń, niszczą jej ochronną warstwę lipidową. Godne polecenia są mydła „bez mydła”, tzw. syndety, które po umyciu pozostawiaja na skórze cienki ochronny film. Należy pamiętać, że część z nich również może uczulać (np. mleczko sojowe obecne w składzie niektórych preparatów), więc wybór musi być indywidualny.